基因样本信息库

2018-05-13

GCBI基因样本信息库聚焦医院、科研院所等单位或组织，提供临床和分子数据的标化，及临床和分子数据的存储、管理和数据挖掘能力，实现临床和分子的大数据挖掘系统。

——标化自有和公共数据，构建特色基因信息数据库

科学研究或临床检测项目得到的数据往往存在描述方式不一，结构化不明确等缺点，为解决这一问题便于数据储存与挖掘，我们通过本体数据库对这些数据进行标化和存储。

本体数据库：使用了很多生物医学本体数据库，如：HPO, MeSH, SNOMED CT, ICD-10等。
样本数据存储和管理：基因样本信息库通过树状结构对分子和医学信息进行结构化存储，树状结构具有数据存储冗余度小、直观性强、检索过程简单高效、节点增删改查操作高效等特点。

——临床与基因数据联合分析，持续产出科研成果

基因样本信息库提供丰富内嵌分析流程，分析各类临床信息与分子数据关系，帮助发现原创、权威的临床基因研究成果。

可视化分析工具：提供多套可视化分析工具，可以直接从树状结构拖拽进入可视化分析流程进行大数据挖掘。例如：Survival Analysis, ANOVA, Heatmap, Hierarchical Clustering , Correlation Analysis, IC50, PCA, Logistic Regression等。
SmartR：引入了基于R语言的外部生物信息算法支持，帮助用户完成更多个性化的挖掘工作，同时减轻语言编程与数据导入的工作量。
基因组浏览器：内嵌的基因组浏览器可以在基因组上展示用户需要查看的数据峰值、位点突变信息、基因信息等。也可以通过添加track文件来丰富基因组浏览器上的内容。