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高通量测序数据分析平台
GCBI高通量测序数据分析平台针对用户的海量测序样本提供进行并行化分析能力,以提高用户的测序样本分析的吞吐能力。
系统亮点
- 采用分布式运算,提升性能和灵活性。
- 样本解析支持多种算法,满足各种分析需求。
- 系统自带丰富的注释库。
- 私有云、公有云均可部署。
业务流程
支持的数据类型
- 全基因组
- 全外显子组
- 靶向捕获
- 转录组
支持的分析算法
根据用户的需求,本系统的每个步骤均可以支持多种算法,具体如下:
分析步骤 | 可选工具 | ||
比对 | bwa | subread | novoalign |
去重 | samblaster | picard | elPrep |
SNP/INDEL | freebayes | GATK | VarScan2 |
CNV | CNVnator | Control-FREEC | Pindel |
SV | LUMPY | Delly2 | BreakDancer |
并行化支持
- 所有的数据类型均支持样本级的并行处理,即计算资源充裕的情况下,多个样本可以并行处理,以提升系统的分析效率。
- 针对全基因组数据还支持单个样本在多个计算节点的并行处理,以实现单个大样本的处理速度。
系统部署方案
典型案例
- 云健康基因科技(上海)有限公司
如何进行数据分析,是联系你们做吗?还是可以在线我们自己分析?
请留下您的单位及联系电话,我们这边会有技术人员联系您。
http://mas.gcbi.com.cn/